اين بقعه شامل تعدادي از بناهاي دوره‌هاي مختلف است كه نخستين بار توسط شاه تهماسب به صورت مجموعه واحد در آمده است . بعدها شاه عباس بناهاي مهم ديگري به اين مجموعه افزوده و اصلاحاتي در آن ايجاد كرده است . اين مجموعه تاريخي با سلسله خاندان سلاطين صفويه مرتبط است . اسلاف شاهان صفوي و همچنين شاه اسماعيل اول در اين مجموعه تاريخي به خاك سپرده شده‌اند . بناي اصلي مقبره شيخ صفي برج استوانه‌اي شكلي است كه بر روي ازاره سنگي هشت پهلويي قرار گرفته است و بلندي برج آن در حدود ۵/17 متر است . در كنار قبر شيخ صفي ، گور فرزندش صدرالدين موسي «باني‌بقعه» و شيخ ابراهيم معروف به شيخ شاه فرزند شيخ خواجه علي - سلطان حيدر (پدر شاه اسماعيل) قرار گرفته است .
در حرمخانه ، شاه اسماعيل صفوي ، دختر شيخ صفي ، دختر شيخ زاهد گيلاني (زن شيخ صفي الدين) ، مادر شاه اسماعيل صفوي (حليمه خاتون) ، و گروهي ديگر از نزديكان دربار صفوي به خاك سپرده شده‌اند .